Το M.U.T.E. Protocol που παρουσίασε η Ubisoft πίσω στον Αύγουστο του 2020 επέστρεψε στο Rainbow Six Siege, όμως αυτή τη φορά ελαφρώς αλλαγμένο και με νέο gameplay.
Το event όταν το πρωτοείδαμε στο Operation Steel Wave ήταν 5vs5 secure area στο map Tower με ένα πρωτοποριακό gameplay. Οι παίκτες έπρεπε να παλέψουν για τον έλεγχο δύο περιοχών στον χάρτη και δεν υπήρχε preparation phase. Με τον νέο μηχανικό κίνησης που ψηφιοποιεί τα σώματα των παικτών κάθε φορά που χρησιμοποιούν κάμερες ή drones, οι παίκτες μπορούσαν να ταξιδέψουν σε όλο το map. Οι attackers μπορούσαν να ταξιδέψουν με drone και να κάνουν spawn όπου κι αν βρίσκεται το drone τους όταν βγουν από την προβολή drone. Εάν το drone όμως καταστρεφόταν, επέστρεφαν στην αρχική τους μορφή στο αρχικό spawn. Παρομοίως γινόταν και με τους Defenders που μπορούσαν να τηλεμεταφέρονται σε όλο τον χάρτη μέσω τοποθετημένων bulletproof καμερών.
Το ανανεωμένο M.U.T.E. Protocol 2022: Flesh and Metal, το οποίο θα είναι διαθέσιμο για τρεις εβδομάδες, από τις 2 Αυγούστου έως τις 23 Αυγούστου, παρουσιάζει ένα νέο game mode που δεν είχαμε ξαναδεί στο παρελθόν στο Siege αλλά γνώριμο για αρκετούς παίκτες Arms Race.
Όταν ένας αντίπαλος γίνεται eliminate τότε ο παίκτης αναβαθμίζει το όπλο του αλλά στην περίπτωση που πεθάνει ο ίδιος χάνει ένα tier. Υπάρχουν 10 στάδια (tier) αναβάθμισης μέχρι το τελικό στάδιο το golden hammer που τότε οι παίκτες για να νικήσουν πρέπει να σπάσουν το “Brain”. Οι δύο ομάδες έχουν δύο ευκαιρίες να το σπάσουν και στην περίπτωση ισοπαλίας έρχεται το sudden death round που οι δύο ομάδες παλεύουν μεταξύ τους με τα golden hammer μέχρι να μείνει μια ομάδα ζωντανή και να νικήσει το game.
Power ups μπορούν να βρουν σε τυχαία σημεία του χάρτη οι παίκτες για να τους βοηθήσουν στον σκοπό τους είτε με έξτρα ζωή είτε με την αναβάθμιση ενός tier και το βασικό τους ability όπως και του Oryx είναι να κάνουν dash και ή να ανοίγουν τα δικά τους rotation σε τοίχους είτε να κάνουν knock out για λίγο τους αντιπάλους.